Beberapa bulan telah berlalu sejak Bencana Besar Akhir Tahun yang disebabkan oleh Tagitsuhime. Mata air baru telah tiba, dan area Tokyo yang rusak parah mulai pulih. Namun, setelah Bencana Besar Akhir Tahun, dengan Aradama lebih sering muncul di seluruh wilayah Kanto, kasus-kasus yang membutuhkan kekuatan Tim Tugas Khusus — Toji, tak kunjung usai. Selama keadaan yang menegangkan ini, sinyal Aradama yang sangat kuat diukur di Enoshima, tempat yang terhubung dengan Toji dan Tagitsuhime.